ونشأ منشأ عجيباً بحيث قد حير ذكائه وجودة فهمه وسرعة انتقاله اساتذه العصر الخ.
فقرء المبادئ الاولية من النحو والصرف والمنطق والمعاني والبيان حتى فاق الاماثل والاقران .
ثم قرء السطوع العالية والمتون الراقية عند علماء عصره وفضلاء بلده : وبعد الفراغ منها أخذ في الحضور على علماء تلك البلدة المقدسة الاعيان وفقهائها الاركان حتى تألق نجمه وعلا ذكره وصار ممن يشار اليه بالبنان من بين الفضلاء الاقران.
ومن ثم اشتاقت نفسه الشريفة الى الارتقاء الى المراتب العالية والدرجات السامية فهاجر الى عاصمة الشيعة ، ومركز فطاحل علماء الشريعة متردداً الى اندية الفحول يكرع من مناهلهم العذبة من المعقول والمنقول حتى صار من ابرز اساتذة الفقه والاصول.
ولما حصل على شهادات الاجتهاد الذي هو أبعد من طول الجهاد من اساتذته الامجاد رجع الى وطنه ومسقط رأسه وبلد أنسه كربلاء المقدسة.
واخذ في التاليف والتضنيف وقضاء الحاجات وفصل الخصومات حيث صار واحد مراجع عصره واعلام زمانه ورؤساء أوانه والكل قد اذعنوا له بالتقدم والتفوق على أمثاله واقرانه.
ولعمري لقد القت الامة زمام الامر عليه وانثالت بالرجوع والتقليد اليه فقام;بأمورهم أحسن قيام وأدى وظيفته الشرعية على اكمل وجه واتم نظام فجزاه الله عن الاسلام واهله خير الجزاء وحشره مع اجداده الطاهرين فى دار السلام.
( مشايخه في القرائة والرواية )
حضر في كربلاء المقدسة على والده العلامة وعلى الفقيه الشهير الشيخ زين العابدين الحائري المازندراني وفي النجف على خاله العلامة المفضال السيد علي الطباطبائي صاحب البرهان القاطع في شرح المختصر النافع المطبوع في طهران وغيرهما من الفطاحل والاعلام اعلى الله مقامهم فى دار السلام : هذا ويروى الاخبار الصادرة عن ائمتنا:المودعة فى الجوامع الكبار لعلمائنا الاخيار عن جماعة من الاكابر والابرار وانهم قد صرحوا فى اجازاتهم له ببلوغه اعلى مراتب الاجتهاد على رؤوس الاشهاد واليك الان أسمائهم الشريفة.
( فمنهم ) :
العلامة الشهير الفقيه الخبير صاحب المقامات السامية والكرامات النامية السيد محمد مهدي الموسوي القزويني صاحب فلك النجاة المتوفى سنة 1300 ه تاريخ الاجازة سنة 1296 ه.
( ومنهم ) :
العالم العابد والفقيه الزاهد العلامة الازهر الشيخ جعفر التستري;المتوفى سنة 1303 ه وقد تناثرت النجوم يوم وفاته : تاريخ الاجازة سنة 1291 ه.
( ومنهم ) :
العلامة الرجالي والفقيه الاصولي السيد محمد هاشم الموسوي
الخونساري صاحب مباني الاصول وأصول آل الرسول وغيرهما من المؤلفات وشقيق صاحب الروضات قدهما المتوفى سنة 1318 ه تاريخ الاجازة سنة 1309 ه.
( ومنهم )
الفقيه الرباني والعالم العامل الصمداني المحلي بكل زين مولانا الشيخ محمد حسين الاردكاني الحائري قده المتوفى سنة 1305 ه : تاريخ الاجازة سنة 1292 ه 6 / شهر ربيع الثاني.
( ومنهم )
حجة الاسلام والمسلمين آية الله في العالمين الميرز حسين نجل المرحوم الميرزا خليل قدهما المتوفى سنة 1326 ه تاريخ الاجازة 1313 ه 10 / ذيحجة الحرام.
( ومنهم )
مرجع عصره ووحيد زمانه العلامة المؤتمن الشيخ محمد حسن آل يس قده المتوفى سنة 1308 ه تاريخ الاجازة سنة 1301 ه شهر ذيحجة الحرام.
( ومنهم )
العالم الفقيه والمحقق الوجيه الرباني ملا محمد الايرواني قده المتوفى سنة 1306 ه تاريخ الاجازة سنة 1299 ه.
( ومنهم )
السيد السند والركن المعتمد الفقيه البارع السيد علي الطباطبائي آل بحر العلوم صاحب البرهان القاطع في الفقه المتوفى سنة 1298 ه تاريخ الاجازة 3 / محرم الحرام سنة 1291 ه ويعبر عنه سيدنا المؤلف قده في رسالته هذه بالاستاذ الخال.
( ومنهم )
شقيق سيدنا المشار اليه العلامة الفقيه السيد حسين الطباطبائي آل بحر العلوم تاريخ الاجازة سنة 1296 ه 24 ذيحجة الحرام.
( ومنهم )
العالم العامل الرباني الفقيه المتبحر الصمداني الشيخ زين العابدين الحائري المازندراني قده المتوفى في الحائر الشريف سنة 1309 ه تاريخ الاجازة سنة 1290 ه 28 صفر الخير.
( ومنهم )
السيد السند والمولى الممجد ابن عم سيدنا المؤلف السيد ميرزا زين العابدين الطباطبائي قدس سره الزكي تاريخ الاجازة سنة 1292 ه.
( ومنهم )
العالم العامل والفقيه الكامل ميرزا ابو تراب الشهير بميرزا آقا القزويني قده تاريخ الاجازة غرة رجب المرجب سنة 1292 ه :
وكان هذا المولى العظيم الشأن من تلامذة شيخنا الانصاري وصاحب الجواهر والشيخ حسن نجل الشيخ الكبير كاشف الغطاء والحاج ملا اسد الله البروجردي قدست أسرارهم.
( وأما الراون عنه ) :
فكثيرون ايضاً جائت اسمائهم الشريفة في بطون كتب التراجم الاجازات : ومنهم : العالم الفاضل السيد محمود المرعشي رحمة الله عليه والد النسابة المعاصر آية الله السيد محمد حسين المعروف بشهاب الدين المرعشي النجفي دامت بركاته كما نقل عنه في هامش ج ل من معارف الرجال ص 281.
( ثناء العلماء عليه )
فقد اثنى عليه العلماء الكملون والفقهاء الراشدون في كتب التراجم والرجال ثناء بليغاً ومدحوه مدحاً جميلا يكشف عن علوّ مقامه السامي في فنون العقلية والنقلية وتفوقه في القواعد الاصولية والفروع الفقية مضافاً الى ما ذكره اساتذته العظام ومشايخه الكرام في اجازاتهم له :
قال استاذه العلامة السيّد علي الطباطبائي صاحب البرهان القاطع في شرح المختصر النافع في اجازته له : مجمع الفضائل منبع الفواصل زبدة الاواخر والاوائل الحري بان يتمثل بقول القائل.
واني وان كنت الاخير زمانه
لات بما لم تستطعه الاوائل
محقق الحقائق كاشف رموز الدقايق موهبة الخالق فى الخلايق
بدر العلم الساطع قمر الفضل الامع الولد العز الافخر قرة العين الازهر السيد محمد جعفر آل الامير السيد علي الطباطبائي الحائري صاحب الرياض فقد اصبح بحمد الله من جهابذة الزمان والعلماء الاعيان يشار اليه بالبنان من كل جانب ومكان وتاهل ان يكون علماً للعباد ومناراً في البلاد ينادى به المناد ويحدو به الحاد ويؤمه الحاضر والباد يرجعون اليه في الحكم والفتيا بالانقياد الخ.
( وقال ) الفاضل الشهير الاردكاني قده في حقه في اجازته له : السيد السند والحبر المعتمد المسدد درّ صدف المجد والسيادة ودرى سماء الفضل والسعادة نور حديقة الفواضل ونور حدقة الفضائل واحد السادة وواسطة القلادة العالم المهذب المطهر والعالم الساطع المضيء الأزهر مولينا السيد محمد جعفر الى ان قال قده : فوجدته قد غاص في التحقيق والتدقيق على اعماق اللجج وشقق الشعرة في ايضاح الادلة والحجج واجاد في اقتناص المدلول من الدليل واستخرج غوامض الفروع من الاصول بوجه انيق جميل وسمح بفوائد لطيفة ومقاصد شريفة الى ان قال قده فهو بحمد الله قد بلغ منتهى معارج الرجال واقصى مدارج الكمال وحاز من الفضل درجة لا تواري ورفعة لا تحاذي وذروة تفوق هي العيوق ويقصر دونهما الانوق الى ان قال : فله من المناقب والمزايا ما فيه شرف مكارم الدنيا ودرك فضائل العقبى فهو امام لمن اقتدى بصر لمن اهتدى ينبغي ان يستعطي منه الهدى ويستجلي منه العمى الخ.
( وقال ) العلامة السيد ميرزا محمد هاشم الخونساري قده في حقه
بما هذا نصه السيد السند المؤيد المسدد العالم العامل الكامل المدقق الفهام بل الحبر الماهر المتتبع المحقق العلام المترقي من حضيض التقليد الى اوج الاجتهاد على وجه الاطلاق الحقيق بان يشد اليه الرحال من اطراف الافاق سليل العلماء الاعلام قدوة الافاضل الفخام مجمع مكارم الاخلاق ومحاسن الخصال والفضائل معدن الزهد والورع والتقوى والفواضل سيدنا الاجل الافخم الاطهر الاغا السيد محمد جعفر.
الى ان قال : فان العبد بعد تشرفي في الحائر الشريف بلقاء جنابه وادراك فيض صحبته وقوفي على جملة من مؤلفاته الشريفة ورسائله المنيفة وجدته مجتهداً جامعاً كاملا في الاحاطة بالقواعد الشرعية وخفايا الاحكام الفرعية فصح لى ان اقول واكتب في حقه اداءاً لبعض ما يستحقه من اظهار مقاماته الرفيعة ان جنابه ايده الله تعالى حقيق بان يتصدي للافناء بين الانام وان يثني له وسادة القضاء والحكم بين الخواص والعوام : وللعوام ان يقلدوه فيما يفتي ويقول فانه منتهى المطلب وغاية المأمول ولعمرى انه احيى ما خفي من مزايا آبائه الكرام وافصح عن نتائج فوائدهم على ما هو المقصود والمرام الخ.
وهكذا بقية مشايخه فقد مدحوه بكل جميل واثنوا عليه بما يستلذ بسماعه النبيل اعلى الله مقامهم جميعاً في اعلى عليين وحشرنا واياهم مع محمد وآله الطاهرين صلوات الله عليهم اجمعين.
هذا وقال : صاحب أحسن الوديعة في ص 157 من ج ل منه من طبع النجف.
العالم الفقيه الفاضل والعلم الوجيه الكامل : كان;اعجوبة عصره وعلامة مصره يرع في الفنون العقلية والنقلية واجتهد في القواعد الاصولية والفروع الفقهية حتى جمع شرائط الامامة وصار قدوة للخاصة والعامة بحيث قد أقر له فقهاء الزمان بالتقدم والفضل على جميع الاقران الى أن قال قده :
وبالجملة فقد كان صدراً رئيساً وسيداً نقريساً وعالماً كبيراً ومجتهداً بصيراً شاع ذكره العالي في الديار واشتهر السامي في الاقطار انتهى.
وقال : سيدنا الامين حشره الله مع أجداده الطاهرين فى الجزء السادس عشر من المجلد السابع عشر من أعيان الشيعة ص 78 طبع دمشق سنة 1359 : بعد ذكر اسمه الشريف : كان عالماً فاضلا كاملا رئيساً وفي بعض مؤلفات أهل العصر كان عالماً فاضلا فقيهاً اصولياً الخ فقد أخذ بذكر مشايخه في القرائة والرواية وبيان مؤلفاته ثم قال ومن شعره الموجود في آخر المجالس النظامية قوله :
واني جعفر المعروف ذكراً
سليل الخمس من آل العبا
علي والدي و به انتسابي
الى جدي الزكي طباطبائي
وقال أيضاً وله شعر طبع بعضه في آخر المجالس النظامية مع تقريظه له فلاحظ. وقال صاحب نجوم السماء في ج 2 ص 215 منه ما هذا نصه :
الميرزا جعفر بن علي نقي حجة الاسلام الطباطبائي الحائري وى از خانواده علم وفضل بوده جليل القدر عظيم المنزلة فاضل وعالم